中枢神经系统感染性疾病，常见的有脑膜炎、脑炎、脑脓肿、脑蛛网膜炎等。这些疾病在发病的过程中，都有非常突出的头痛症。
其中流行性脑膜炎、结核性脑膜炎、病毒性脑膜炎所引起的头痛，头痛剧烈，伴有恶心、呕吐，颈部抵抗，病人可出现高热、抽搐、昏迷，好发于儿童。急性发作头痛时中医治疗应清热解毒，药用：银花20克，连翘20克，大青叶20克，南沙参15克，白花蛇舌草30克，柴胡6克，生地15克，鲜芦根24克，鱼腥草30克，黄芩10克，红枣5枚。
针灸：穴取百会、太阳、风池，配合合谷、内关，手法中刺激，留针30分钟。
如果脑炎后遗头痛伴有轻度抽搐、手足不遂的患者，可用滋阴解毒法，药用生地15克，竹叶10克，生石膏20克，黄芩10克，麦冬12克，川芎10克，白蒺藜12克，钩藤12克，赤芍10克，生甘草6克。
