流脑要注意与结核性脑膜炎相区别。
流脑起病比较急，流行季节在冬春，有流脑接触史，皮肤常有出血点，脑脊液外观为混浊脓性，细胞数多在500×106/升以上。结核性脑膜炎，由病缓慢，多有结核病史或结核病接触史，中等度发热、消瘦、盗汗等症状多见；
脑脊液可呈毛玻璃样，细胞数多在500×106/升以内，以单核细胞为主，薄膜形成试验可阳性；涂片、培养或动物接种可找到结核杆菌；结核性脑膜炎皮肤没有出血点，没有明显的流行季节，这都与流脑有明显不同
